El Órgano de Control Institucional es la unidad encargada de ejecutar el control interno integral dentro de la UGEL N.° 12.

Su labor principal consiste en auditar el uso eficiente y transparente de los activos públicos (humanos, financieros y materiales).

Asimismo, garantiza que los procesos administrativos se ajusten a la normativa vigente y supervisa el cumplimiento de las responsabilidades funcionales, derivando recomendaciones estratégicas de sus evaluaciones.